Α螺旋

取自 食品百科全书

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α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构.它和Β-折叠层(β-折叠)一起被称为规则二级结构(regular secondary structures), 因为他们都具有重复的Φ和Ψ值(Cα-N夹角和Cα-C夹角).

α-螺旋是右手螺旋.在α-螺旋中, 平均每个螺旋周期包含 3.6 个氨基酸残基,残基侧链伸向外侧,同一肽链上的每个残基的酰胺氢原子和位于它后面的第4个残基上的羰基氧原子之间形成氢键.N--O距离是2.8Α. 这种氢键大致与螺旋轴平行。一条多肽链呈α-螺旋构象的推动力就是所有肽键上的酰胺氢和羰基氧之间形成的链内氢键。在水环境中,肽键上的酰胺氢和羰基氧既能形成内部(α-螺旋内)的氢键,也能与水分子形成氢键。如果后者发生,多肽链呈现类似变性蛋白质那样的伸展构象。疏水环境对于氢键的形成没有影响,因此,更可能促进α-螺旋结构的形成。


α-螺旋中,氨基酸的R基团指向外和向下.这样以来就避免了与多肽链的主干部分之间的的位阻影响(steric interference).螺旋的核心部分紧密结合,原子之间以范德华力联系在一起.


因为其特殊的环状R基团,脯氨酸(Proline)一般不出现在α-螺旋中,而经常出现在α-螺旋的开始处.

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